Аэропорт был закрыт на реконструкцию с 20 января 2011 года. В рамках первого этапа реализации проекта были выполнены работы по реконструкции ВВП размерами 2500 х 45 м, водосточно-дренажной сети, светосигнального оборудования. Весь комплекс работ был завершен в кратчайшие сроки – за четыре месяца.

      Реконструкция позволит аэропорту снять ограничения по приему воздушных судов иностранного производства, таких как А319 или Boeing 737.
     Ранее сообщалось, что открытие аэропорта Анапы после реконструкции ВВП предполагалось 1 июня. Но в итоге, как сообщила пресс-служба "БазЭл Аэро", которая управляет аэропортом, открытие было отложено на неопределенное время из-за бюрократических препятствий. Людям, которые вылетали транзитом из Санкт-Петербурга, пришлось поинтересоваться объявлением "Посуточная аренда квартир в Санкт-Петербурге".
   "По информации представителей заказчика реконструкции взлетно-посадочной полосы ФГУП "Администрация гражданских аэропортов (аэродромов)", существуют бюрократические препятствия, затягивающие получение разрешения ввода в эксплуатацию данной полосы", - говорилось в сообщении пресс-службы.